Türkiye Eğitim Sağlık ve Araştırma Vakfı (TESA) tarafından kurulmuştur.
Vakfın kurucusu, Medipol Sağlık Grubu Yönetim Kurulu Başkanı Dr. Fahrettin Koca’dır.
Üniversitemiz, 7 Temmuz 2009 tarih ve 27281 sayılı Resmi Gazete’de yayımlanan 28 Mart 1983 tarih ve 2809 sayılı Yükseköğretim Kurumları Teşkilatı Kanunu’nda değişiklik yapılmasına dair 5913 sayılı Kanun’a eklenen Ek 112. madde ile vakıf üniversitesi olarak kamu tüzel kişiliğine kavuşmuştur.
İstanbul Medipol Üniversitesi, sağlık hizmeti öncelikli olmak üzere, evrensel, çağdaş, nitelikli, özgür, üretken ve geliştiren bir üniversite olarak gençlere yeni fırsatlar sunmak amacındadır.
İstanbul Medipol Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Eczacılık Fakültesi, Diş Hekimliği Fakültesi ve Sağlık Bilimleri Fakültesi’nde eğitime başlamıştır. Tarihi yarımadada kurulu, İstanbul’un her yönünden ulaşılabilen merkezi konumdaki Avrupa yerleşkesinde 2010- 2011 öğretim yılında bu fakültelere öğrenci kabul etmiş,bu bölümlere ek olarak 2011-2012 öğretim yılında Hukuk Fakültesine de öğrenci kabul etmektedir.
Avrupa yerleşkesi, tarihi Bizans surlarının çevrelediği İstanbul'un en eski bölgesi olan yarımadada Haliç kenarında ve Unkapanı köprüsünün kara ile buluştuğu noktada yer almaktadır. Bu bölgede Osmanlı devrinde ticari hayatın kalbinde yer alan ve 19. yüzyıla kadar kullanılan Zeugma yer alıyordu.
Bizansın izlerini taşıyan ve Osmanlı’nın ticari hayatının merkezinde yer alan bu bölgenin tarihi dokusu içinde Cumhuriyet’in bir işareti olarak modern tarzda inşa edilmiş olan ve farklı işlevleriyle Tekel’e hizmet etmiş olan tesislerde bugün bir eğitim kurumu yer almaktadır. Kurucu Vakıf tarafından orijinal karakteri ve mimari birliği korunarak kısa sürede onarılan tesis, üniversitenin ihtiyaçlarına cevap verecek şekilde değerlendirilmiştir.
İstanbul Medipol Üniversitesi'nin Avrupa yerleşkesi, geçmişin mirası üzerine bir gelecek inşa etme ve toplumun sürekli değişen ihtiyaçlarıyla artan beklentilerine cevap verme azmiyle İstanbul'un kalbinde kültür, eğitim ve bilimsel araştırmanın buluştuğu bir merkez olacaktır.
Haliç kenarında, İstanbul'un tarihi dokusu içinde geçmişin izlerini taşıyan bölgede şimdi bilim üretilmekte ve çağdaş eğitim verilmektedir. Yerleşkede rektörlük ile birlikte eğitime başlamış olan bölümler, derslikler, laboratuvarlar ve merkezi kütüphane bulunmaktadır.